L’EHESS s'engage dans de nombreux Laboratoires d'excellence (Labex), des projets collectifs implantés en Ile-de-France, sur les sites de Marseille et de Toulouse. L’institution a notamment la responsabilité du Labex TEPSIS.

En Ile-de-France

  • Labex TEPSISTransformation de l'État, politisation des sociétés, institution du social
  • CAPCréation art et patrimoine
  • CORAIL, Les récifs coralliens face au changement global de la planète
  • DYNAMITE, Dynamiques territoriales et spatiales 
  • HASTEC, Histoire et anthropologie des savoirs, des techniques et des croyances
  • IEC, Institut des sciences cognitives 
  • OSE, Ouvrir les sciences économiques
  • TranferS
  • SITES, Sciences innovations techniques en société

À Marseille

  • AMSE, Aix-Marseille sciences économiques
  • MEDLes sciences humaines et sociales au cœur de l’interdisciplinarité pour la Méditerranée

À Toulouse